Dependency files under output directory

[efiop]

i.e.

dvc run -c . -f unarchive.dvc -d data/Posts.xml.tgz -o data/xml/ tar zxf data/Posts.xml.tgz  -C data/xml/
dvc run -c . -f tsv.dvc -d data/xml/ -d code/xml_to_tsv.py -d code/conf.py -o data/tsv/ python code/xml_to_tsv.py
dvc run -c . -f split.dvc -d data/tsv/ -d code/split_train_test.py -d code/conf.py -o data/tt/  python code/split_train_test.py 0.33 20180319
dvc run -c . -f feature.dvc -d code/featurization.py -d code/conf.py -d data/tt -o data/matrix/ python code/featurization.py
dvc run -c . -f model.dvc -d data/matrix/matrix-train.p -d code/train_model.py -d code/conf.py -o data/model/model.p python code/train_model.py 20180319
dvc run -c . -f Dvcfile -d data/model/model.p -d data/matrix/matrix-test.p -d code/evaluate.py -d code/conf.py -o data/eval.txt python code/evaluate.py

Kudos @Nicolabo !